Исток Акацки
Так как лидер Акацки из Амегакуре, можно предположить, что организация была основана именно там. Однако из-за создания Тоби и его власти над Пэйном это предположение ставится под вопрос.
Позже Конан объясняет, что с начала Акацки была группа мятежников, которую создал Яхико во время третьей мировой войны. Их изначальной целью было принести мир и закончить войну. После смерти Яхико и многих других членов группы, Нагато решает переделать Акацки в преступную организацию, которая будет его поддерживать в его планах касающихся мира и справедливости.
Тоби утверждает, что он подтолкнул Яхико к созданию Акацки.
Кроме того, по словам Райкаге есть слухи, что создание Акацки произошло в Киригакуре. Позже этот слух опровергается.
Цель
Цель организации в конечном счете господство над миром. Его они пытаются достичь, собирая всех Биджу и извлекая его с помощью Фуиндзюцу: Генрью Кью Фуджин из Джинчурики. В последствие этого Джинчуурики умирает, а Чакра Биджу запечатывается в статуе еретика. После сбора всех хвостатых демонов, Тоби хочет объединить всех хвостатых и возродить Джуби, затем, став его Джинчурики, придать своему Шарингану былую мощь и погрузить мир в вечную иллюзию Мугeн Тсукyёми, которой будет управлять.
Прошлое
Так как в последнее время не было войн, деревни Шиноби не могут себе позволить просить так мало денег. По этому маленькие деревни нанимают Акацки, вместо дорогих деревень Шиноби. Из-за Чакры Биджу, Акацки способны в любое время начать войну и сразу же окончить, что бы улучшить свою репутацию и сделать так, что бы страны зависели от них. Так как деревни Шиноби стали бы безработными, они бы просто погибли от недостатка средств.
И так как Акацки стала бы величайшей силой Шиноби, они бы смогли без труда завоевать другие страны. Не смотря на то что это весьма веский и обширный план, не все члены Акацки знают о нем при своём поступлении - на пример Хидан узнал о нем только после того как уже некоторое время был членом Акацки.
Истинные намерения
Однако лидеры Акацки, Пэйн или Нагато и Тоби, преследуют разные планы, которые в конце приводят к одной и той же цели: Оба в поиске справедливости. Нагато собирается осуществить ее с помощью оружия, которое он хочет сделать из Чакры всех девяти Биджу.
Однако таким образом он не стремится, в отличии от Тоби, к самодержавию над человечеством, а хочет мир на земле. У Мадары схожие намерения, но он хочет подчинить себе человечество с помощью Муген Тсукуёми, что бы создать мир. Правда после смерти Нагато его представление о мире уходит в небытие.